Se le scappava la pipì, da qualche parte l'ha fatta di sicuro e presumibilmente poca, visto che è solo dall'altra notte che ha mangiato qualcosa e non è detto che abbia anche bevuto.
Prima di sentire la puzza l'urina deve deteriorarsi quel tanto che basta, ma se l'avesse fatta in qualche punto nascosto o su qualche cosa di assorbente, dovresti arrivarci vicino col naso, per accorgertene.

Quando vai in quella stanza, lascia aperta la porta, così da non farla sentire obbligata alla tua presenza senza possibilità di fuga, anzi, lascerei sempre aperta la porta, in modo che pian piano possa esplorare tutto l'appartamento, quando si sentirà pronta, e nel frattempo possa abituarsi ai rumori e agli odori di tutta la casa.
Tenerla confinata in quella stanza come se fosse in una scatola chiusa non mi sembra una buona idea.